眼睛扁平疣需要在医生指导下使用抗病毒的软膏进行涂抹，在涂抹前需要将局部清洁干净，避免出现交叉感染，而且也有利于药效的吸收和利用，另外也要避免对局部进行抓挠，避免出现传染。眼睛扁平疣的发病可能是受到了病毒的感染引起的，也可能是自身免疫力低下导致的，在发病期间通常会使局部出现红肿和疼痛，并且还会伴随着肿胀。