男性龟头上长有肉芽，可能是以下原因造成的：首先，可能是患者得了尖锐湿疣，一般会致使龟头出现肉芽或造成乳头痒，并且有的会有丘疹样突起，一般体积和大小数目会慢慢增大增多，表面变得不光滑，有的会出血或融合变成菜花样肿块儿，有疼痛，且有异味儿。其次，可能是阴茎珍珠样丘疹，一般在阴茎龟头以及冠状沟出现肉芽状变化。