扁平疣是一种病毒性皮肤病，容易反复发作，目前没有一种很好的药物能彻底根治。局部可以外用药物治疗，如咪喹莫特乳膏或者维A酸乳膏。也可以液氮冷冻，微波，电灼或者二氧化碳激光治疗。同时也可以光动力治疗。如果出现反复发作的情况，可以口服免疫调节药物，如胸腺肽或者转移因子。日常生活需要注意，尽量不饮酒，不吃辛辣刺激性食物，以免刺激引起痒而搔抓导致自身接种到身体的其它部位。