阴茎根部皮肤有疙瘩，有几种情况：有些是毛囊炎导致，主要情况表现为局部的红肿，丘疹，脓丘疹，疼痛明显。如果是毛囊炎，可以局部外涂消炎的药膏，如夫西地酸乳膏，或者莫匹罗星乳膏抗炎治疗，同时避免挤压，以免感染播散。还有一种情况考虑是病毒感染的寻常疣，或者尖锐湿疣，出现这种情况可以到医院做一个人乳头瘤基因分型，确诊一下，看看具体是什么情况导致，如果是病毒疣可以使用液氮冷冻治疗，或者激光治疗。