在临床中引起小便疼痛的原因主要包括以下两大方面：1、由泌尿系的炎症所引起，例如尿道炎、膀胱炎或前列腺炎，当出现可疑有泌尿系统炎症时需要进行尿常规检测，通过尿常规检测结果，结合患者其他症状，基本上能够予以确诊。2、也有可能是由于泌尿系统结石所引起小便疼痛，当怀疑有结石时需要进行泌尿系B超或CT检测，通过检测能够发现结石的位置、大小、形态，根据引起的原因对症治疗，从而能够将小便疼痛的症状予以治愈。