阴茎上有小疙瘩，常见原因如下：一、皮脂腺异位症，一般皮脂腺异位症会表现为阴茎或者阴囊部位有小疙瘩，小疙瘩呈现白色或淡红色。患者一般没有任何不适，也不需要特殊处理，对身体没有任何影响。二、尖锐湿疣，一般尖锐湿疣是通过性接触传播引起，主要表现为阴茎上有散在疣体，疣体呈鸡冠状或菜花状，需要及时规范治疗。