女性感染霉菌时要用抗真菌的药物进行治疗。妇科方面感染霉菌主要指的是患有霉菌性阴道炎，也就是念珠菌性阴道炎，它可以通过口服抗真菌的药物进行治疗，比如可以口服氟康唑或者伊曲康唑进行治疗。如果患者对口服用药不能耐受，可以选择阴道局部塞药进行治疗，也要选择抗真菌的药物，比如可以通过阴道塞达克宁栓，克霉唑阴道泡腾片，盐酸特比奈芬阴道泡腾片等进行治疗，同时，可以配合一些中成药的妇科洗液，比如苦参洗液、红核妇洁洗液等，清洗外阴，冲洗阴道或者坐浴来帮助治疗。