喉咙两侧疼这种情况有可能存在甲状腺炎，也就是亚急性甲状腺炎，尤其是近期有病毒感染以后，更容易出现这种情况，患者除了喉咙两侧疼痛以外可能还伴有发热、周身酸痛、心慌、多汗等，疼痛严重者可以向肩背部放散，发热时体温往往在38.5℃以下，出现了这种情况，建议及时到内分泌科去就诊，通过查血沉血常规以及甲状腺功能来明确。