对于十二指肠球部溃疡的治疗，首先应进行幽门螺杆菌的检测，如果结果为阳性，建议积极除菌治疗。目前临床上采用四联疗法除菌治疗，包括两种抗生素，一种质子泵抑制剂和一种铋剂，抗生素可以选择阿莫西林克拉霉素、左氧氟沙星、四环素等。质子泵抑制剂可以选择奥美拉唑、雷贝拉唑以及兰索拉唑。铋剂可以选择胶体果胶铋以及胶体酒石酸铋，疗程为十天至14天。同时对于溃疡的治疗还可以给予保护胃粘膜的药物，例如麦滋林、硫糖铝以及瑞巴派特；还可以加用促胃肠动力药包括莫沙必利、多潘立酮等，与其他药物至少需间隔1小时以上服用。此外，还有抑酸药，服药疗程应达到6至8周。