男人小便时尿道刺痛的原因，与泌尿道感染以及泌尿道结石有关。男人小便刺痛，伴有尿频、尿急，一般是泌尿道感染。如果有刺痛，尿道内有异物感、尿道有流血，可能是尿道结石。建议到正规医院做尿常规检查、B超检查，明确诊断。如果是尿道有结石，要确定结石的大小、位置。小的结石大量喝水，吃排石药物可以促进排出体外。大的结石，必须通过膀胱镜将结石取出。