小便时出现疼痛的原因，一种情况可能是由泌尿系的炎症或泌尿系结石所引起。泌尿系炎症包括尿道炎、前列腺炎、膀胱炎，三种类型的炎症均有可能会导致小便的疼痛。另一种情况可能是由于泌尿系的结石所引起，包括肾结石、膀胱结石、输尿管结石。因此，出现小便疼痛时应当第一时间到正规医院的泌尿外科进行就诊，常常需要进行尿常规、前列腺液常规以及泌尿系B超检测，根据检测结果往往能够进行确诊。如果是由于结石引起的尿痛，需要根据结石的位置、大小、形态，选择合适的排石手段。