消化不良伴有肚子疼痛，主要就是应用一些健胃消食的药物，配合应用一些乳酸菌等进行调理治疗。出现肚子疼痛，可以适当的进行局部的热敷和按摩，做好饮食方面的调理，不要吃任何刺激性的食物，不要吃一些太硬的食物，不能吃太凉的食物，就有利于疼痛的恢复。如果疼痛长时间没有好转，建议还是需要适当的加入一些保护胃肠黏膜的药物，共同进行治疗。