射精的过程是在神经支配下，由生殖器官、盆底肌肉、尿道以及尿道周围的肌肉节律性协同收缩而完成，部位的功能和结构异常均可在射精过程中出现不舒服的感觉或者隐痛，严重者可以表现为明显的疼痛不适。造成射精疼痛的病因可能包括以下几个方面，如心理因素包括了紧张、焦虑、抑郁等不良心理因素，常见于神经过敏、情绪不稳定以及神经官能症患者，可以增加性器官的敏感性，并造成局部肌肉的痉挛性收缩，因此而出现射精疼痛，还有是性交频度和强度异常，造成射精疼痛，射精频度过高，由于性器官的过度工作而得不到必要的休整，就会引起射精疼痛。性交动作过于猛烈，尤其是长时间没有性生活的男性，在突然恢复性交后容易出现粗暴的性行为而诱发射精疼痛，过分干燥的性器官在性交时缺乏润滑作用，而容易诱发射精疼痛。最后疾病因素，如泌尿生殖系统的疾病，可以导致射精疼痛，主要包括了炎症，如前列腺炎、精囊炎，结石如输尿管结石、膀胱结石，生殖器的肿瘤和其他疾病，如尿道狭窄等可以诱发射精疼痛。