女性在小便的时候疼痛，可能是与泌尿系统感染有一定关系，比如常见的有尿道炎、膀胱炎等疾病有关。与平时不注意个人卫生或者不洁性生活、机体免疫力下降等因素有关，身体就容易受到细菌及其它致病菌的入侵，从而引起泌尿系统的感染，当炎症刺激尿道、膀胱时，会引起小便的时候有疼痛不适感。另外，女性在小便的时候疼痛可能也与结石有关系，当结石处于活动期的时候，会引起排尿疼痛的症状，常见于尿道结石、膀胱结石、输尿管结石，建议去专业的泌尿外科做尿常规、泌尿系彩超等检查，找出病因后针对性的治疗。治疗期间多喝水多排尿，保证每天的饮水量在1500-2000ml左右，有助于改善症状。