嘴巴长疱疹一般认为是单纯疱疹，单纯疱疹是由单纯疱疹病毒感染所引起的，所以在治疗上，以抗病毒治疗为主，辅以调节免疫，防止继发感染的治疗原则。抗病毒的药物一般选择阿昔洛韦、伐昔洛韦；调节免疫力的药物，一般选择转移因子、干扰素、胸腺肽等。如果因为皮损的破溃，出现了糜烂，有继发感染的可能时，可以酌情使用抗生素治疗。对于皮损的外治，一般选择阿昔洛韦软膏、干扰素凝胶等，合并有感染时，可以联合百多邦、红霉素软膏一同使用。