膝关节疼痛的原因有以下几种：1.自身免疫性疾病，最多见的是风湿、类风湿性关节炎，造成关节软骨及周围软组织的变性、后期软骨下骨出现囊性变。2.退行性病变，最多见的是骨性关节炎，是由于关节软骨在长时间慢性损伤下造成的软骨变性及剥脱，后期出现软骨下骨质外露，关节周围骨赘形成，关节间隙变窄。3.代谢性疾病，最常见的是痛风，是由于体内嘌呤代谢异常造成的高尿酸血症，急性发作期尿酸结晶渗出造成疼痛明显。