肛门脓肿的治疗主要包括局部的处理以及全身的治疗，出现肛门脓肿时，应该进行手术切开，更好地排出脓液，才能达到更好的治疗效果，也需要使用双氧水，碘伏进行消毒处理，可以更好地减轻炎症，促进病情的恢复。同时，也应该定期的消毒，换药，对症处理。另外，使用敏感的抗生素抗感染治疗，这是相当重要的，必要时需要取分泌物进行药物敏感试验，选择敏感的抗生素抗感染治疗，只有炎症得到控制，病情才可以缓解。同时，饮食上也应该减少炎症刺激，以清淡饮食为主，多吃新鲜的蔬菜水果。