男性小便的疼痛考虑可能是急性的膀胱炎，慢性的前列腺炎以及尿道炎导致的，可以到医院进行泌尿系的彩超和尿常规检查。如果尿道口有明显的分泌物需要进行分泌物的涂片检查，必要的情况下需要进行尿液的培养，明确具体的致病菌。泌尿系感染多伴有尿频尿急等症状，和包皮的过长有一定的关系。如果有白细胞和红细胞的明显增多，是需要及时的口服抗生素进行处理的。