原发性临床甲减的治疗目标是甲减的症状和体征消失，TSH 、TT4、FT4值维持在正常范围，左甲状腺素是甲状腺功能减退的主要替代治疗药物，一般需要终身替代治疗。而左甲状腺素治疗药物的剂量取决于患者的病情、年龄、体重，所以治疗要个体化。对于患缺血性心脏病者起始剂量应该小一些，调整剂量也应该慢一些，防止诱发和加重心脏病，甲减替代治疗药物的起始剂量和达到完全替代剂量所需要的时间也要根据病情进行个体化的选择。除了甲减的替代治疗之外，甲减患者也可以适当的给予一些对症治疗，如纠正贫血、改善胃肠道功能等等。