小便痛出血与膀胱炎、泌尿系结石、泌尿系肿瘤等疾病有关。膀胱炎由于细菌侵入膀胱而导致膀胱发炎，在炎症的刺激下出现尿频、尿急、小便痛出血的情况。泌尿系结石由于结石向下移动中，摩擦肾盂、输尿管、膀胱和尿道内黏膜，毛细血管破裂会导致疼痛及出血。泌尿系肿瘤，由于肿瘤迅速生长，肿瘤内毛细血管牵拉断裂，会导致小便痛出血的现象。