部分患者在使用复方酮康唑发用洗剂，会出现一些副作用。一般有局部皮肤的过敏反应，表现为有灼烧感，瘙痒，刺激，还可出现有头发干枯，脱发等。部分患者还会出现有皮肤的红斑，干燥，毛囊炎，皮肤出现萎缩变薄，有萎缩纹，毛细血管扩张，可有局部皮肤的色素沉着。极少数患者可能会出现有变态反应性皮炎。如果长期使用这种洗剂，还可能会导致出现肾上腺皮质功能亢进，表现为多毛，满月脸，以及骨质疏松等副作用。