肛门如果有疼痛，需要第一时间进行检查，一般通过肛门的望诊，肛门的指诊来明确诊断。肛门疼痛最常见的原因就是肛裂、肛门脓肿的情况，所以，还是需要先检查，再治疗。如果是肛裂引起来的，可以进行药物的保守治疗，一般是中药的坐浴和熏洗，还可以将药膏和药栓塞入到肛门里面进行治疗；如果是肛周脓肿引起来的疼痛，主要治疗的方法是需要通过手术，术后一定要按时换药，防止复发。