本质区别和根本区别都一样：组成脱氧核苷酸的碱基和排列顺序不一样。

等位基因，又称对偶基因。等位基因指位于一对同源染色的相同位置上控制着相对性状的一对基因，是一些占据染色体的基因座可以复制的脱氧核糖核酸。大部分时候是脱氧核糖核酸序列，有的时候也被用来形容非基因序列。