子宫内膜异位症癌变非常少见，一般表现为多年的巧囊突然增大、腔内回声不均质、巧囊边界不甚清楚、肿瘤标记物显著升高等等，有时会出现腹痛等肿瘤破裂迹象。对于有这些临床表现的患者，一般要及时手术治疗，开腹或者腹腔镜手术探查，如果确实存在恶变情况，要按卵巢癌给予根治术，术后多需要补充化疗。这种内膜异位症癌变，病理类型多为透明细胞癌，一般预后较差，当然，早期发现早期癌预后明显要好于晚期癌。