脚趾甲长进肉里可以选择的治疗方法如下：首先，进行修甲。需要将长进肉里的指甲剪出，养成良好的修甲习惯。其次，涂抹药物。需要涂抹碘伏消毒，也可以用酒精进行消毒。涂抹药物的时候使用一次性棉签，还需要再进行消毒之后涂抹药膏，也能够使脚趾甲长进肉里的症状得到缓解。同时要注重在平时，养成良好的清洁卫生习惯。