脑血栓的治疗分为急性期治疗以及后遗症阶段治疗。脑血栓的急性期治疗，通常以静脉输液为主，治疗药物选择需要包括抗血小板凝集、稳定血管斑块、改善脑循环以及改善脑细胞代谢药物，治疗以最大限度保护损伤脑细胞为目的。脑血栓后遗症阶段的治疗用药，一般要包括常规抗动脉硬化药物，以及改善脑细胞代谢药物，同时需要控制和脑血栓相关的血糖、血压、血脂等危险因素，并辅助以功能康复锻炼。这个阶段治疗的目的有两个：一、通过康复锻炼，尽可能多的恢复丧失掉的功能；二、通过长期的药物维持，避免再发脑血栓。