新生儿消化不良原因有两种情况：母乳喂养引起的，再就是奶粉喂养。如果是母乳喂养，首先宝宝本身的胃肠功能还没有发育完全，会出现消化不良的情况，这种情况可以口服一些妈咪爱或者是益生菌之类的，主要是调节胃肠功能。另一种情况是由于配方奶粉出现的消化不良，很有可能是配方奶粉的问题，建议赶紧换一种奶粉，或者是进行母乳喂养，这样会使宝宝大便好一点。这两种情况无论是哪一种，首先建议母乳喂养为主，另一种情况出现就是宝宝的胃肠功能还没有发育完全，引起来的消化不良。