临床上结肠炎如果是急性出现的，多半考虑可能是一些进食了不洁饮食或者是一些刺激性食物，也见于一些感染性的问题。对于这些结肠炎，临床上可以服用一些肠道益生菌、或者是调节肠道功能的一些药物如曲美布汀进行辅助治疗，同时加用一些复方谷氨酰胺肠溶胶囊保护肠黏膜治疗，大多数患者呈自限性的过程。对于一些慢性结肠炎如溃疡性结肠炎或者是克罗恩病这种类型的慢性肠炎，临床上需要采用的是一些抗炎免疫的药物。在溃疡性结肠炎当中首选5-氨基水杨酸类的药物如美沙拉嗪或者是激素进行治疗。对于难治性的溃疡性结肠炎可能是需要生物制剂治疗。而在克罗恩病的患者当中，首选是生物制剂进行治疗。当然对于一些轻症的患者也可以采用一些激素加上硫唑嘌呤或者是美沙拉嗪的这些药物进行辅助治疗，往往它的药物治疗疗程是非常长的。特殊的一些病人甚至可能需要进行手术治疗。