小便后尿道刺痛最常见是泌尿系统的感染，泌尿系统的感染病原体很多，最常见是革兰氏阴性杆菌，比如说大肠埃希菌肺炎、肺炎克雷伯杆菌等，革兰氏阴性杆菌感染后会出现排尿疼痛、尿道刺痛、尿频、尿急等症状。对于这类泌尿道感染，可以口服左氧氟沙星、头孢克肟等抗生素进行治疗，治疗后尿频、尿急、尿痛等症状会逐渐缓解。此外还可以见于支原体、衣原体等少见病原体的感染，感染后会导致淋菌性的尿道炎，排尿会有刺痛感，同时尿道口会流出稀薄的脓液，行尿道分泌物核酸检查可以明确诊断。对于这类感染可以口服多西环素、左氧氟沙星等抗感染治疗。