肛门里面隐隐作痛，考虑患者存在肛肠科病变，建议就诊，明确病变类型再进行治疗。首先，考虑患者是否存在肛窦炎。由于局部发生炎症、感染性病变导致患者出现肛门里面疼痛、瘙痒以及里急后重感。需要局部使用抗生素药物进行抗炎治疗，同时注意饮食习惯调整。其次，如果是肛周脓肿病变导致肛门里面出现疼痛，对于早期轻症患者，需要使用抗生素药物抗炎治疗，促进脓肿吸收消退。对于病情严重的患者，必须及早手术，将脓肿的脓液清除。最后，如果是肛瘘病变，建议及早手术，将瘘管切除或者通过挂线疗法来缓慢治疗肛瘘，确保患者彻底治愈。