脑部囊肿手术如果是采取微创手术，一般手术时间在90~120分钟左右。这种微创的手术时间不长、损伤也不大，病人所需的康复时间比较短。但是也有一些患者脑部囊肿手术比较复杂，需要开颅切除脑部的囊肿，这样手术时间相对就比较长一些，有可能需要三四个小时甚至更长。这种情况下相对风险就比较大一些，有可能会出现一些副损伤或并发症，但这种手术相对还是比较安全。