子宫内膜异位症的发病原因还不是很清楚，目前异位子宫内膜的来源有三种学说：一、种植学说是目前公认最重要的学说，这一理论认为异位内膜来源于子宫内膜组织，这些组织转移到宫腔以外的部位并种植和生长，同时经过经血的逆流、淋巴传播、血管传播和医源性种植等，引起子宫内膜异位症。二、体腔上皮化生学说认为异位的内膜细胞来源于盆腔腹膜的体腔上皮。三、诱导学说，也就是未分化的腹膜组织在内源性生物化学因素的诱导下，可发展为子宫内膜组织，种植的内膜可以释放化学物质，诱导未分化的间充质形成子宫内膜异位的组织，同时内异位症还与遗传、免疫以及炎症有一定的关系。