肾脏结石有肾积水，怎么排出，需要根据具体检查的结果来决定，1、如果是肾脏结石病原发病，肾脏积水为继发病，则只需要处理肾脏结石，则积水不需处理可自愈。因为肾积水，是结石导致的输尿管或者肾盂出口的堵塞而造成有积水。当结石排除以后，堵塞去除以后积水可以自然通过输尿管引流而不需要任何治疗。2、如果是先有积水为原发病，而其后形成的继发性的结石，则此时需要通过输尿管支架管引流、肾脏穿刺造瘘或者手术等方法，再排除积水去除结石。因为先有积水，积水长时间的沉淀故而形成有肾脏结石，如果仅仅处理肾脏结石，积水仍然可以存在。多见于泌尿系统的狭窄或者先天性的疾病，或者反流性的疾病导致。需要根据相关的检查，明确病因以后对症处理，比如先天性的疾病，需要通过手术的方法来解除先天性的梗阻，达到恢复泌尿道通畅的问题，积水可以恢复至正常的状态。但如果是反流性的疾病或者其他原因所致的积水，则需要通过引流造瘘等方法来缓解积水。