婴儿的消化器官功能未完善、受凉、病毒感染或者饮食不当都可以造成婴儿消化功能紊乱。应该如何用药包括以下几方面：第一、胃黏膜保护药：这种药物不但对消化道黏膜具有极强的覆盖能力，还能吸附病原体，主要用于治疗急慢性的腹泻，尤其是小婴儿的病毒性腹泻比如秋季腹泻，因为没有杀菌作用，所以不是一种抗生素。二、助消化药，婴儿消化不良还可以使用很多助消化药，让胃肠道的消化功能运作好起来，这类药物的代表作有胃蛋白酶、胰酶、多酶片、乳酶生等。此外，宝宝出现消化不良的时候，可以适当服一些副作用比较小的中药类的消化药，如三公仔小儿七星茶、衍生开奶茶等，也能起到一定的辅助消化作用。小儿胃动力药主要是促进胃排空，加强胃肠蠕动，可以用一些妈咪爱等这一类的药，通常情况下，消化不良不太建议吃完全的止泻药，除非腹泻很严重，才可以吃止泻药。