肝性脑病的治疗原则是积极治疗原发肝病，去除引发肝性脑病的诱因，维护肝脏功能，促进氨代谢清除及调节神经递质。要去除引发肝性脑病的诱因，需要纠正电解质和酸碱平衡紊乱，止血和清除肠道积血，预防和控制感染，慎用镇静药及损伤肝功能的药物。需要保持大便通畅，可给予乳果糖保证每日排软便2至3次，避免粪便在肠腔内停留时间过长而导致毒素如氨等物质被人体吸收而加重肝性脑病。肠道微生态制剂，如复方嗜酸乳杆菌，双歧杆菌，酪酸菌等可以通过调节肠道菌群结构，抑制产氨、产尿素酶细菌的生长，对减少氨的生成有一定作用。