扁平疣疾病本身是属于一种人类乳头瘤病毒感染之后导致的，对于扁平疣的治疗方法也是很多的。从最保守的单纯使用外用药，如重组人干扰素来抗病毒治疗、咪喹莫特乳膏调节局部免疫，也可以外涂维甲酸类药物，促进表皮代谢。另外也可以选择无力的办法，如激光、冷冻或者光动力的方式，将疣体去掉。比较泛发的也可以选择系统口服药物，如异维A酸口服或肌注卡介菌多糖核酸等，均能有良好的临床疗效。