在临床上，对于是否形成肛瘘的判断，主要根据以下几个方面。第一，要根据病史，临床症状以及肛周的查体。如果患者以前得过肛周脓肿，在肛周脓肿的破溃口或者切开引流口。如果有间断性的疼痛，肿胀，破溃，流脓，此时要高度怀疑肛瘘的形成，在进行肛周查体。如果能够发现明确的内口还有外口，就可以确诊肛瘘。第二，影像学检查，现在临床上应用比较多，比如说盆腔的核磁共振以及腔内彩超，不只是可以确诊肛瘘，还可以大概了解肛瘘瘘管的走行以及内口的大概位置。第三，可以进行探针检查，以及肛门镜检查，直肠指诊等等。