反流性食管炎往往和胃酸分泌过多，胃酸反流到食管内灼伤食管黏膜有非常密切的关系，所以当出现反流性食管炎时，首先使用抑制胃酸分泌的药物来进行治疗，抑制胃酸的分泌能够从病因上治疗反流性食管炎，最常使用的是质子泵抑制剂，代表药物有奥美拉唑或雷贝拉唑。这类药物建议在每天早上起床后空腹状态使用，抑制胃酸的分泌，能够避免胃酸反流导致的食管损伤。其次，可以使用胃肠动力药来促进胃内食物的排空，例如枸橼酸莫沙必利片，促进胃的排空 可以防止胃内容物以及消化液的反流。