如果子宫内膜异位症疼得厉害，可以采取药物治疗和手术治疗。药物治疗主要是非甾体内抗炎药，具有解热镇痛的作用，常用的有芬必得；也可以口服短效避孕药，可以直接作用子宫内膜和异位的内膜，导致内膜萎缩而减轻疼痛；也可以使用孕三烯酮、达那唑等，起到假绝经疗法，有利于缓解疼痛。如果通过药物治疗疼痛的症状没有缓解，局部病变加剧，可以采取手术的治疗。手术的治疗包括保留生育功能的手术、保留卵巢功能的手术、根治性手术。根治性手术适用于45岁以上的重症患者，术后不用雌激素补充治疗者几乎不复发。