如果想要肛瘘治疗，不管是中医治疗还是药物治疗效果都不好，最好的治疗方法是手术治疗。常用的手术方式包括：第一、瘘管切开术，适用于瘘管属括约肌间型或经括约肌型的较浅部分的肛瘘，切开以后不会引起术后肛门失禁。第二、挂线疗法，是一种缓慢切开法，利用橡皮筋的机械压迫作用，使结扎处的组织逐渐的压迫坏死，在切割过程中，基底创面逐渐的愈合，防止肛瘘急性感染的发生。第三、肛瘘切除术，主要适用于低位单纯性的肛瘘，切开瘘管以后，将瘘管壁全部切除，使内小外大，不予以缝合，从基底部逐渐的愈合。