小儿病毒性口腔疱疹主要是由于引起手足口病的肠道病毒，或者单纯疱疹病毒感染引起的。治疗主要采用对症支持治疗，早期可以使用一些抗病毒药物，如：利巴韦林喷雾剂，干扰素喷雾剂，或者口服阿昔洛韦抗病毒治疗。也可口服一些清热解毒的中成药物抗病毒治疗，如：双黄连口服液。如果有发烧，需要给予降温，镇静，防止高热惊厥。对于腋温超过38.5℃的小儿，可使用退热药物，如：布洛芬退烧。对于腋温低于38.5℃的小儿可给予物理降温，如：温水擦浴。如果宝宝口腔黏膜溃烂较严重，可给予开喉剑喷雾剂喷在口腔内部，也可给予外涂蒙脱石散涂在口腔溃疡上面，以减少摩擦，减轻疼痛，促进疱疹和溃疡的愈合。合并细菌感染时，要及时使用消炎药物进行协同抗感染治疗，同时给予口服维生素B，多吃蔬菜水果，做好个人卫生，严重患者需要及时住院治疗。