治疗胃肠炎需要给予止泻、消炎、抑酸等药物治疗。止泻药物可以选择蒙脱石散、地芬诺酯或洛派丁胺等等。消炎药物可以口服中成药制剂黄连素，也可以口服喹诺酮类药物，比如左氧氟沙星，但需要注意18岁以下人群，孕产妇及哺乳期妇女是禁用的。抑制胃酸分泌的药物可以给予奥美拉唑，潘托拉唑等质子泵抑制剂或者雷尼替丁、西米替丁等h2受体拮抗剂。