结肠炎的原因是比较复杂，结肠炎的发生和免疫因素、遗传因素、环境因素和感染因素都具有一定的关系。首先很多结肠炎是由于自身免疫系统的疾病所导致，由于肾上腺皮质激素可以使病情缓解，在部分患者的血清当中，可以检查到一些抗结肠上皮细胞的抗体。在患者感染肠道细菌之后，可能会与结肠上皮细胞的抗原起到一定的免疫反应，所以和细胞介导的免疫是具有一定的关系。此外结肠炎和遗传还具有一定的关系，在发达国家和地区结肠炎的发病率会更高一些，可能和生活习惯具有一定的关系。另外经常发生一些肠道的感染也会容易导致结肠炎的发生，所以很多结肠炎的病人都具有肠道的感染病史。