阿莫西林为青霉素类抗生素，对肺炎链球菌，溶血性链球菌，葡萄球菌和流感嗜血杆菌所致的中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染，和急性支气管炎，肺炎等下呼吸道感染疗效较好。对大肠埃希氏菌，奇异变形杆菌或粪肠球菌所致的泌尿生殖道感染都有较好的治疗作用，也可用于溶血性链球菌，葡萄球菌或大肠埃希氏菌所致的皮肤软组织感染，急性单纯性淋病。还可用于治疗伤寒，伤寒带菌者及钩端螺旋体病。阿莫西林也可和克拉霉素、兰索拉唑三联用于根除胃、十二指肠幽门螺旋杆菌的感染，降低消化道溃疡的发病率。