脑囊虫病的治疗方案主要包括药物治疗以及手术治疗。在药物治疗方面，以驱虫药物治疗为主。如果患者脑囊虫数量相对较少，未处于重要功能位置，在服用驱虫药物以后治疗效果较好。没有严重并发症，则以口服药为首选。如果患者脑囊虫数量较多，或位于重要脑功能位置，已经合并明显脑功能损伤症状，或患者在服用驱虫药物后治疗效果不佳，可以选择手术治疗。在治疗期间患者需要调整生活习惯，杜绝饮用生水以及吃生食。