乙肝小三阳的药物治疗要根据肝脏是否有炎症损伤和纤维化来确定，具体措施如下：一、如果小三阳、HBVDNA阴性、肝功能和肝胆脾彩超正常，这种情况说明病情稳定，肝损伤非常轻，是不需要药物治疗的，只要定期复查就可以了。二、小三阳伴有代偿期肝硬化，只要HBVDNA阳性，要口服核苷类或核苷酸类抗病毒药恩替卡韦、或富马酸替诺福韦二吡呋酯和富马酸丙酚替诺富韦。三、小三阳、失代偿期肝硬化，无论HBVDNA是否阳性，都要口服以上三种药物中的一种。四、小三阳、HBVDNA阳性，肝功能和肝胆脾彩超或肝纤维化无创诊断检查提示有明显的肝脏炎症损伤和纤维化，则需要抗病毒治疗。抗病毒药物有两类，一类是上面提到的核苷类或核苷酸类抗病毒药，另一类是长效干扰素。以上两类药物必须在专科医生指导下根据病情选择应用，而且要定期复查，监测和随访。