肛窦炎一方面与患者身体抵抗力低下有关，另外也与粪便的长期刺激有关。肛窦属于人体的正常结构，位于肛管直肠的分界线齿状线部位，实际上就是肛瓣和肛柱下端共同围成的开口向上的小隐窝，局部有肛门腺的开口。由于肛窦的窦口朝上，所以容易积存粪便，这是肛窦炎发病的解剖基础。当患者频繁便秘、腹泻时，不仅容易在肛窦内积存粪便，而且还容易导致肛窦部位损伤，进而导致感染的发病。此外，如果患者身体抵抗力低下，肛窦炎也容易发病。