得了囊肿不来月经了，具体如何处理，需要根据具体病情情况而定。如果是卵巢囊肿，需要确诊是患有多囊卵巢综合征，还是巧克力囊肿。如果是多囊卵巢影响了卵巢内分泌功能，导致内分泌失调，卵巢分泌的雌激素和孕激素不足，雄激素分泌量旺盛，就会引起月经失调，出现不来月经现象。需要配合医生采取药物治疗，改善症状。如果是巧克力囊肿或者其他囊肿引起不来月经，需要手术切除囊肿，促使卵巢内分泌功能恢复正常，有助于促使月经恢复正常。