出现长期的头痛往往是由于颅脑功能性的疾病，例如偏头痛，丛集性的头痛，紧张性的头痛，还可以见于颅脑占位性的病变。功能性头痛的特点是通过患者颅脑磁共振的检查，并无特殊的器质性的疾病，但是患者的头痛往往反复发作，和个人的情绪习惯、生活习惯都有一定的关系。此类功能性的疾病往往难以彻底治愈，可通过药物干预以及心理方式的调节，尽量减少疾病的发作次数。颅脑占位性的病变也可以出现长期的疼痛，可通过颅脑磁共振的检查明确诊断。