在临床上男性感染支原体、衣原体后所出现的症状有：第一，尿痛。经常表现为尿道内的不适、发痒、刺痛，甚至是尿道灼热感，症状时轻时重，反复发作。第二，尿道分泌物及尿道红肿。分泌物常为浆液性或黏液性，但分泌量比较少，如果长时间未排尿或者是早晨首次排尿前可能看到少量的分泌物溢出尿道口，分泌物经常污染内裤，如果结成黏糊状可能封住尿道外口，同时尿道外口红、肿。第三，伴随症状。如果感染到膀胱可以出现血尿；如果感染到附睾可以出现附睾肿大、变硬，甚至是触痛；如果感染到睾丸，可以出现睾丸的疼痛、触痛，甚至是阴囊水肿和输精管变粗等。